El torneo Clausura 2016 terminó su fase de clasificación al jugarse la jornada 22 y donde se definió también los seis clasificados a la fase final del torneo y teniendo al primero y segundo directos a la semifinal, mientras que del tercero al sexto jugarán dos llaves por dos boletos a semifinales.
Cabe mencionar que en el acumulado el equipo de la Universidad de San Carlos desciende a la Primera División, por su parte Malacateco jugará al mismo tiempo por las semifinales y por no descender.
Liga Nacional Clausura 2015-2016
| Pos. | Equipo | JJ | JG | JP | GF | GC | GD | PTS |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
Suchitepéquez |
22 | 12 | 7 | 36 | 23 | 13 | 39 |
| 2 |
Municipal |
22 | 9 | 4 | 29 | 21 | 8 | 36 |
| 3 |
Comunicaciones |
22 | 9 | 8 | 32 | 27 | 5 | 32 |
| 4 |
Malacateco |
22 | 9 | 9 | 35 | 24 | 11 | 31 |
| 5 |
Antigua |
22 | 8 | 7 | 27 | 23 | 4 | 31 |
| 6 |
Marquense |
22 | 8 | 7 | 30 | 29 | 1 | 31 |
| 7 |
Guastatoya |
22 | 10 | 11 | 25 | 28 | -3 | 31 |
| 8 |
Mictlán |
22 | 8 | 8 | 21 | 27 | -6 | 30 |
| 9 |
Usac |
22 | 8 | 9 | 32 | 29 | 3 | 29 |
| 10 |
Xelajú |
22 | 5 | 8 | 19 | 25 | -6 | 24 |
| 11 |
Petapa |
22 | 5 | 9 | 33 | 40 | -7 | 23 |
| 12 |
Cobán Imperial |
22 | 5 | 9 | 17 | 40 | -23 | 23 |
